蛋白质组学质谱平台

主要工作及研究内容

1 ．中国疾病预防控制中心传染病预防控制所科研及疾控相关蛋白质鉴定及病原菌落鉴定。

2 ．传染病蛋白质组学研究，包括修饰蛋白质组学、差异蛋白质组学、多肽组学等研究。

3 ．基于质谱的传染病分型研究。

完成工作及项目

完成脑膜炎奈瑟菌、鼠疫耶尔森氏菌、炭疽杆菌、结核分支杆菌、空肠弯曲菌、幽门螺杆菌、金黄色葡萄球菌、脑脊液、弓形虫、蝎毒、霍乱弧菌、甲状腺、致病大肠杆菌、猪链球菌、小肠耶尔森氏菌、布鲁氏菌、伤寒、巴尔通体、阮病毒等在内的基于 2D 胶、 SDS-PAGE 、 LC 途经的近 80000 蛋白点的分析。完成幽门螺杆菌 CagA 阳性株及 CagA 缺失株与 AGS 细胞相互作用的磷酸化蛋白质组学分析，幽门螺杆菌作用前后 U937 细胞的蛋白质组变化、幽门螺杆菌对宿主细胞作用的比较蛋白质组学分析、幽门螺杆菌对小鼠胃粘膜作用的蛋白质组学分析、幽门螺杆菌尿抗原的分析。幽门螺杆菌感染相关胃粘膜分离细菌的质谱鉴定。完成重组大肠杆菌的质谱识别分析。完成幽门螺杆菌相关特异性尿液多肽蛋白质组分析；阮病毒相关脑脊液多肽蛋白质组学分析。 400 株病原菌多肽谱数据库的建立。

参与的项目有： 国家高技术研究发展计划（ 863 计划）：《布鲁氏菌病快速诊断技术标志性抗原研究》，编号： 2007AA02Z410 。国家高技术研究发展计划 (863 计划 ) ：《鼠疫特异性诊断新技术的建立及应用评价》，编号： 2006AA02Z4A7 ；国家科技支撑计划：我国幽门螺杆菌感染诊断和治疗的规范化研究，项目编号： 2007BAI04B02 。

发表文章

•  Xiao D, Meng FL, He LH, Gu YX, Zhang JZ. Analysis of the urinary peptidome associated with Helicobacter pylori infection.World J Gastroenterol 2011; 17(5): 618-624

•  肖迪，陶晓霞，孟凡亮，王海滨，乔博，何利华，李培京，张建中 . 幽门螺杆菌作用后 AGS 细胞内钙离子的动态变化研究 . 现代消化及介入诊疗， 2010,15 （ 1 ）： 1-6.

•  肖迪 , 宋衍燕 , 赵飞 , 等 . 幽门螺杆菌感染后人胃粘膜上皮细胞微量磷酸化蛋白质差异分析 . 中华微生物学和免疫学杂志 ,2009,29(5):449-453.

•  闫笑梅 , 肖迪 , 赵飞等 . EI Tor 型霍乱弧菌分泌性蛋白初步分析 . 微生物学报 , 2009,49 （ 6 ） :746-758.

•  肖迪 , 赵飞 , 宋衍燕等 . 幽门螺杆菌 CagA 对 AGS 细胞 RNA 转录相关磷酸化蛋白的影响 . 胃肠病学和肝病学杂志 , 2009, 18(4):332-336.

•  肖迪 , 赵飞 , 孟凡亮等 . 人胃上皮细胞中幽门螺杆菌 CagA 相关未知磷酸化蛋白和磷酸化位点分析 . 胃肠病学 , 2009, 14(1): 22-26.

•  肖迪 , 赵飞 , 宋衍燕等 . CagA 对 AGS 细胞 Ca2 ＋相关蛋白磷酸化情况的影响 . 世界华人消化杂志 , 2008, 16(32): 3610-3615.

•  Mao-Jun Zhang, Di Xiao, Fei Zhao, Yi-Xin Gu, Fan-Liang Meng, Li-Hua He, Guang-Yuan Ma, Jian-Zhong Zhang. Comparative Proteomic Analysis of Campylobacter jejuni Cultured at 37 ℃ and 42 ℃ . Jpn.J.Infect.Dis.2009,62:356-361.

•  Zhang MJ, Zhao F, Xiao D, Gu YX, Meng FL, He LH, Zhang JZ. Comparative proteomic analysis of passaged Helicobacter pylori. J Basic Microbiol, 2009,49:1-9.

•  姜葵 , 赵飞 , 王邦茂 , 肖迪等 . 幽门螺杆菌 26695 及其不同克拉霉素耐药水平衍生株的比较蛋白质组学分析 . 胃肠病学 , 2007,12(9): 545-550.

•  胡源 , 邵祝军 , 闫笑梅等 . 我国脑膜炎奈瑟菌孔蛋白 PorA 、 PorB 的多态性分析 . 中华微生物学和免疫学杂志 , 2007,27(3):218-221.

•  姜海 , 曾浔 , 尤元海 , 肖迪等 . 肠道常见病原菌检测基因芯片的制 备与评价 . 中国公共卫生 , 2006,22(10):1197-1198.

•  胡源，邵祝军，闫笑梅等 . C 群脑膜炎奈瑟菌部分蛋白表型特征分析 . 疾病监测 , 2006,21(8):428-430.

•  宋衍燕 , 赵飞 , 肖迪等 . 幽门螺杆菌与胃上皮细胞不同作用时间点蛋白质组的差异分析 . 世界华人消化杂志 , 2008,16(12):1260-1265.

•  郑明寰，闫笑梅，何利华，孟凡亮，赵飞，顾一心，张茂俊，肖迪，胡源，尤元海，张慧芳，唐光鹏，聂炜，焦振泉，张丽杰，王子军，张建中 . 68 株急性肾小球肾炎暴发相关 A 组链球菌耐药性分析 . 中华疾病预防控制杂志， 12(6) ： 570-572.

•  Ming-huan Zheng, Zhen-quan Jiao, Li-jie Zhang, Sang-jie Yu, Guang-peng Tang, Xiao-mei Yan, Li-hua He, Fan-liang Meng, Fei Zhao, Mao-jun Zhang, Di Xiao, Yong-hong Yang, Wei Nie, Jian-zhong Zhang, Zi-jun Wang. Genetic Analysis of Group A Streptococcus Isolates Recovered during Acute Glomerulonephritis Outbreaks in Guizhou Province of China . J. Clin. Microbiol. ( 2008-12-23 , accepted).

. 李晶 , 赵飞 , 肖迪 , 何丽华 , 张建中 . 幽门螺杆菌动物模型驯化菌株 SS1 与其初始菌株的差异蛋白质组分析 . 世界华人消化杂志 , 2009,17 （ 15 ）： 1508-1512.

. 郭凤华，胡源，赵飞，徐冬蕾，蔡虹，肖迪，顾一心，张建中。鼠疫耶尔森菌 EV76 免疫蛋白质组学初步分析。环境与健康杂志 2010 ； 27 （ 4 ）： 308-310.

. yuan HU , Zhu-Jun SHAO, Xiao-Mei YAN, Po-Qing LI, Fei ZHAO, Di XIAO, Jun REN Ming-Huan ZHENG, Chuan-Xiang FAN , Li-Hua HE, Li XU,Yi-Xin GU, Hai JIANG, Feng-Hua GUO, Zhen-Wei DAI, Hong-Yu REN, Mei-Juan LU, Xia CHEN, Qing-Hua ZOU, Fan-Liang MENG, Jian-Zhong ZHANG. Proteome Analysis of Neisseria meningitidis Serogroup C Strains Associated with Outbreaks in China . Biomed Environ Sci. 2010, 23(4):167-172.

工作人员及联系方式

张建中（实验室负责人）： zhangjianzhong@icdc.cn

肖迪（质谱平台负责人）： xdtornadoes@vip.sina.com

张慧芳

张永婵

合作意向：

欢迎各疾控中心、高校、医院与我们进行病原菌、疾病相关蛋白质组学及多肽组学的合作研究。

仪器设备

•  4700 Proteomics Analyz

4700 MALDI-TOF/TOF 蛋白质组分析系统是全球第一台 TOF/TOF 串联飞行质谱仪，它作为目前的最新质谱技术，它一问世即被世界各大蛋白组研究中心和著名蛋白质实验室所争相采用。它由两级 TOF 和高能碰撞池组成，其工作原理是离子在 MALDI 源中产生并被加速和聚焦；对于 MS/MS 模式可通过第一级 TOF 选择母离子进入高能碰撞池中碰碎，然后进入第二级 TOF 重新被加速并被分析。

功能 / 应用范围：

蛋白质的鉴定，分子量测定，翻译后修饰， De-novo

主要附件：

MALDI 离子源 , 线性检测器 , 反射式检测器， HPLC,2D-HPLC

主要技术指标：

分辨率： 1-2 万，灵敏度： pmol-fmol ，检测范围 <400kDa

各种采样模式的精确度及采样范围 :

技术特色：

高通量、高灵敏度、高分辨率、 MSMS ，与 HPLC 联用

•  Microflex

布鲁克公司的 Microflex 是 MALDI 源的线性飞行时间质谱仪。含有 Biotyper 及 Clinprotools 软件系统。 MALDI Biotyper 高通量微生物鉴定系统可以满足微生物的快速鉴定与分类的需求。该系统的 Biotyper 数据库，具有快速简便的工作流程和强大可靠的数据处理能力，是微生物鉴别与分类中的最新技术。目前数据库内含有 3740 个（ 1600 多种）细菌的特征谱图。

Biotyper 工作原理：

每种微生物都有自身独特的蛋白质组成，因而拥有独特的蛋白质指纹图谱。通过检测微生物蛋白指纹图谱，利用 Biotyper 软件对这些指纹图谱进行处理并和数据库中各种已知微生物的标准指纹图谱进行比对，从而完成对微生物的鉴定识别。

通过质谱仪采集谱图，利用 Clinprotools 系统可进行多肽组学的研究，确定疾病相关的 Marker 肽。

血清多肽谱分析

•  AXIMA Assurance

岛津公司 Assurance ? MALDI MS 型质谱仪，是只有线性模式的 MALDI-TOF 质谱仪。它适用于以下领域的高通量 QA/QC 分析：寡核苷酸 / 引物分析，合成多肽 / 蛋白、聚合物、和其它小分子。 AXIMA@SARAMIS TM 系统是微生物样品鉴定与分类的系统，拥有含有 2160 种细菌的超级谱库及 40000 株细菌的肽质量指纹谱库。样品处理简单，可在 5 小时内完成 380 个样品的识别鉴定。